Расшифровка заболеваний по коду: МКБ-10 онлайн, коды заболеваний, расшифровка диагнозов

ВОЗ ввела срочные изменения в МКБ-10 по COVID-19 » Медвестник

Всемирная организация здравоохранения внесла срочные изменения в международную классификацию болезней 10-го и 11-го пересмотра, добавив в них коды, необходимые для учета пациентов с заболеваниями COVID-19.

ВОЗ внесла изменения:

1. В раздел «Вирусная инфекция неуточненной локализации (B34)» (класс «Некоторые инфекционные и паразитарные болезни (A00-B99)», подкласс «Другие вирусные болезни (B25-B34)» добавлено уточнение, что для нозологии «Коронавирусная инфекция неуточненной локализации» (код B34.2) исключены значения: «COVID-19, вирус идентифицирован (U07.1)» и «COVID-19, вирус не идентифицирован (U07.2)»

2. В подкласс «Временные обозначения новых диагнозов неясной этиологии или для использования в чрезвычайных ситуациях (U00-U49)» (класс «Коды для особых целей (U00-U85)») внесены правки:

a) В разделе «Тяжелый острый респираторный синдром (SARS) (U04)» добавлено уточнение, что для нозологии «Тяжелый острый респираторный синдром неуточненный» (код U04.9) исключены значения: «COVID-19, вирус идентифицирован (U07.1)» и «COVID-19, вирус не идентифицирован (U07.2)».

b) В разделе «Использовать в чрезвычайных ситуациях (U07)» добавлены новые значения:

i. «COVID-19, вирус идентифицирован» (код U07.1). Пояснение: используйте этот код, когда COVID-19 был подтвержден лабораторными исследованиями, независимо от тяжести клинических признаков или симптомов. При необходимости указать пневмонию или другие проявления инфекции используйте дополнительный код. Исключены: коронавирусная инфекция неуточненная (B34.2), коронавирус как причина болезней, классифицированных в других рубриках (B97.2), тяжелый острый респираторный синдром (ОРВИ) неуточненный (U04.9).

ii. «COVID-19, вирус не идентифицирован» (код U07.2). Пояснение: используйте этот код, если COVID-19 диагностирован клинически или эпидемиологически, но лабораторные исследования неубедительны или недоступны. При необходимости указать пневмонию или другие проявления инфекции используйте дополнительный код. Исключены: коронавирусная инфекция неуточненная (B34.2), COVID-19: подтверждено лабораторными испытаниями (U07.1), специальный скрининг-осмотр (Z11.5), подозревался, но исключен отрицательными лабораторными результатами (Z03.8).

ВОЗ внесла дополнительно разъяснение о том, что коды U00-U49 должны использоваться лишь для временного кодирования новых заболеваний с неопределенной этиологией. Для кодирования COVID-19 необходимо применять уточненную спецификацию категории U07. Разработчикам электронных систем необходимо обеспечить доступность этой категории и подкатегорий для того, чтобы они могли быть немедленно использованы по указанию ВОЗ.

Минздрав России своим письмом № 13-2/И/2-4335 от 8 апреля 2020 года за подписью замминистра Евгения Камкина довел до региональных ОУЗ, федеральных учреждений здравоохранения, ФМБА, ФНС и Росстата эту информацию.

Перечень заболеваний (кодов МКБ-10) по профилю «гематология/онкология», по которым осуществляются дистанционные консультации

Коды заболеваний в больничных листах, расшифровка причин нетрудоспособности в больничном листе

В бланке листка нетрудоспособности образца 2011 года есть несколько ячеек, в которых должны быть проставлены те или иные коды. Основные – это коды заболеваний в больничном листе. Они утверждены приказом Минздравсоцразвития России от 29 июня 2011 г. №624н. Рассмотрим подробно, что означает тот или иной код.

Расшифровка кодов больничных листов

Коды прописываются в нескольких местах. На изображении листка нетрудоспособности мы обвели красным те ячейки, которые предназначены для кодов больничных листов. Их расшифровка приведена на обороте больничного. Это коды причины нетрудоспособности, родственной связи, отметки о нарушении режима, условия исчисления и ячейка «иное». Практически все они заполняются врачом, и только «условия исчисления» — код, предназначенный для работодателя.

Первыми идут коды причины нетрудоспособности в больничном листе. Расшифровка этих кодов приведена в таблице:

Коды причины нетрудоспособности имеют еще и дополнительные ячейки. Это «доп код» и «код изм».

В первом случае в трех ячейках при необходимости, дается дополнительная кодированная информация. В них трехзначным кодом обозначаются:

Если подобных «дополнений» нет, ячейки «доп код» не заполняются. И последние коды нетрудоспособности в больничном листе – это «код изм». Он заполняется двузначным кодом заболевания (приведены в первой таблице), если изменилась причина болезни. Если причина нетрудоспособности не менялась, код не заполняется.

Следующий код нужен, если больничный лист выдан по уходу за больным ребенком (членом семьи). Это двузначный код «родственная связь». Варианты следующие:

То есть, если в причине нетрудоспособности указаны цифры 09, а в родственной связи – 39, то бухгалтеру будет ясно, что больничный лист выдан по уходу за ребенком отцу ребенка. Так как оплата больничных пособий ФСС имеет в каждом случае свои особенности (оплата декретного отпуска или травма на производстве, уход за ребенком-инвалидом и т.п.), на коды важно обращать внимание.

Код в ячейках «отметки о нарушении режима» тоже двузначный. При наличии нарушения, туда вписываются следующие значения:

Заметим, что, если в ячейке «доп код» будет стоять 021, даже при отсутствии отметок о нарушении режима работодатель выплачивает пособие по болезни исходя из МРОТ, причем за весь период нетрудоспособности. Болезнь вследствие алкогольного опьянения карается уменьшением суммы пособия.

А вот если дополнительного кода нет, но стоит отметка о нарушении режима, например, 23 или 24, то сумма пособия тоже снижается. Но исходя из МРОТ она будет выплачена не за все время болезни, а с момента выявления нарушения.

Последний код, который может проставить медработник, это «иное». Там могут быть следующие коды:

Зная все коды, бухгалтер легко разберется, какой именно больничный был выдан, по какому заболеванию, был ли нарушен назначенный врачом режим и как исходя из этих данных, надо будет считать выплаты работнику. Кроме того, эта информация позволит организации или ИП заполнить свой код «условия исчисления». Если условий несколько, их можно указать более, чем одно.

Еще один код, который заполняет работодатель, это код подчиненности. Его можно найти в уведомлении о регистрации в ФСС в качестве работодателя либо проверить на сайте Фонда.

Новые перечни заболеваний, при наличии которых предоставляются льготы при обеспечении жильём

Перечень заболеваний, дающих инвалидам, страдающим ими, право на дополнительную жилую площадь

Заболевания, указанные в Перечне, предоставляют право на получение дополнительной жилой площади. Основание — статья 17 Федерального Закона Р. Ф. «О социальной защите инвалидов в Российской Федерации»: людям с инвалидностью может быть предоставлено жилое помещение по договору социального найма общей площадью, превышающей норму предоставления на одного человека (но не более чем в два раза), если они страдают тяжелыми формами хронических заболеваний, предусмотренных перечнем, устанавливаемым уполномоченным Правительством Российской Федерации федеральным органом исполнительной власти. Действующий перечень заболеваний утвержден Постановлением Правительства Р. Ф. от 21.12.2004 № 817, текст постановления размещен на сайте «Российской газеты».

В новом Перечне заболеваний указаны не только наименования заболеваний, но и коды в соответствии с Международной классификацией болезней 10-го пересмотра (МКБ-10). Международная классификация болезней содержит классы (разделы) кодов заболеваний и состояний. Разрабатывает МКБ Всемирная организация здравоохранения, и под ее руководством происходит пересмотр классификации.

В новом Перечне значительно изменилась формулировка пункта о психических заболеваниях. Если по действующему Перечню право на дополнительную жилплощадь возникает при наличии «психического заболевания, требующего обязательного диспансерного наблюдения», то по новому Перечню такое право предоставляется при наличии отдельных «хронических и затяжных психических расстройств с тяжелыми стойкими или часто обостряющимися болезненными проявлениями».

Формулировка заболеваний, предоставляющих право на дополнительную жилую площадь «колясочникам», дополнена псориазом артропатическим, требующим применения инвалидных кресел-колясок. В остальном формулировки остались прежними: к таким заболеваниям, в частности, относятся органические заболевания центральной нервной системы со стойким нарушением функции нижних конечностей, требующие применения инвалидных кресел-колясок, и (или) с нарушением функции тазовых органов. Новый Перечень дополнен кодами конкретных заболеваний, включая код G80, обозначающий детский церебральный паралич.

Выдержки из Перечня с расшифровкой кодов

Действующий Перечень

2.Психические заболевания, требующие обязательного диспансерного наблюдения.

8.Органические заболевания центральной нервной системы со стойким нарушением функции нижних конечностей, требующие применения инвалидных кресел-колясок, и (или) с нарушением функции тазовых органов.

Новый Перечень

2.Хронические и затяжные психические расстройства с тяжелыми стойкими или часто обостряющимися болезненными проявлениями: F01; F03 — F09; F20 — F29; F30 — F33.

Расшифровка кодов:

• F01 — сосудистая деменция
• F03 — F09 — деменция неуточненная; органический амнестический синдром, не вызванный алкоголем или другими психоактивными веществами; делирий, не вызванный алкоголем или другими психоактивными веществами, другие психические расстройства, обусловленные повреждением и дисфункцией головного мозга или соматической болезнью; расстройства личности и поведения, обусловленные болезнью, повреждением или дисфункцией головного мозга; органическое или симптоматическое психическое расстройство неуточненное.
• F20 Шизофрения
• F21 Шизотипическое расстройство
• F22 Хронические бредовые расстройства
• F23 Острые и преходящие психотические расстройства
• F24 Индуцированное бредовое расстройство
• F25 Шизоаффективные расстройства
• F28 Другие неорганические психотические расстройства
• F29 Неорганический психоз неуточненный

8.Органические заболевания центральной нервной системы со стойким нарушением функции нижних конечностей, требующие применения инвалидных кресел-колясок, и (или) с нарушением функции тазовых органов — G35; G60.0; G71.2; G80; T90.2 — T90.9; T91.1; T91.3; Z99.3; Z99.8.

Расшифровка кодов:

• G35 Рассеянный склероз
• G60.0 Наследственная моторная и сенсорная невропатия
• G71.2 Врожденные миопатии
• G80 Детский церебральный паралич
• T90.2 Последствия перелома черепа и костей лица
• T90.3 Последствия травмы черепных нервов
• T90.4 Последствия травмы глаза окологлазничной области
• T90.5 Последствия внутричерепной травмы
• T90.8 Последствия других уточненных травм головы
• T90.9 Последствия неуточненной травмы головы
• T91.1 Последствия перелома позвоночника
• T91.3 Последствия травмы спинного мозга
• Z99.3 Зависимость от кресла на колесах
• Z99.8 Зависимость от других вспомогательных механизмов и устройств

Перечень тяжелых форм хронических заболеваний, при которых невозможно совместное проживание граждан в одной квартире

Если в составе семьи имеется больной, страдающий тяжелой формой хронического заболевания из этого Перечня, то семья, при соблюдении условий, предусмотренных жилищным законодательством, признается нуждающейся в жилых помещениях, предоставляемых по договорам социального найма; при этом жилье должно быть предоставлено вне очереди; площадь помещения может превышать норму предоставления на одного человека, но не более чем в два раза (ст.ст.51, 57, 58 Жилищного кодекса РФ).

Действующий перечень утвержден Постановлением Правительства Р. Ф. от 16.06.2006 № 378, его можно увидеть на сайте «Российской газеты».

Новым Приказом значительно сокращен перечень хронических и затяжных психических расстройств с тяжелыми стойкими или часто обостряющимися болезненными проявлениями. По действующему Перечню к таким заболеваниям относится весь класс МКБ-10 «Психические расстройства и расстройства поведения» — F00-F99. В этот класс входит, например, блок F70-F79 «Умственная отсталость», блок F80-F89 «Расстройства психологического развития», блок F90-F98 «Эмоциональные расстройства, расстройства поведения, обычно начинающиеся в детском и подростковом возрасте». Новый Перечень ограничивается заболеваниями с кодами F20-F29; F30-F33.

Раздел «Эпилепсия с частыми припадками» дополнен кодом G41 — Эпилептический статус.

Если на момент постановки семьи на учет в качестве нуждающихся в жилых помещениях заболевание ребенка входило в Перечень хронических заболеваний, при которых невозможно совместное проживание граждан в одной квартире, но в новом Перечне это заболевание отсутствует, то это обстоятельство не лишает семью права на внеочередное получение жилого помещения.

Выдержки из Перечня с расшифровкой кодов

Действующий Перечень

3.Хронические и затяжные психические расстройства с тяжелыми стойкими или часто обостряющимися болезненными проявлениями F00 — F99.

Расшифровка кодов (по блокам):

• F00-F09 Органические, включая симптоматические, психические расстройства
• F10-F19 Психические расстройства и расстройства поведения, связанные с употреблением психоактивных веществ
• F20-F29 Шизофрения, шизотипические и бредовые расстройства
• F30-F39 Расстройства настроения (аффективные расстройства)
• F40-F48 Невротические, связанные со стессом, и соматоформные расстройства
• F50-F59 Поведенческие синдромы, связанные с физиологическими нарушениями и физическими факторами
• F60-F69 Расстройства личности и поведения в зрелом возрасте
• F70-F79 Умственная отсталость
• F80-F89 Расстройства психологического развития
• F90-F98 Эмоциональные расстройства, расстройства поведения, обычно начинающиеся в детском и подростковом возрасте
• F99 Неуточненные психические расстройства

4.Эпилепсия с частыми припадками — G40

Расшифровка кодов:

Новый перечень

3.Хронические и затяжные психические расстройства с тяжелыми стойкими или часто обостряющимися болезненными проявлениями F20 — F29; F30 — F33

Расшифровка кодов:

• F20 Шизофрения
• F21 Шизотипическое расстройство
• F22 Хронические бредовые расстройства
• F23 Острые и преходящие психотические расстройства
• F24 Индуцированное бредовое расстройство
• F25 Шизоаффективные расстройства
• F28 Другие неорганические психотические расстройства
• F29 Неорганический психоз неуточненный
• F30 Маниакальный эпизод
• F31 Биполярное аффективное расстройство
• F32 Депрессивный эпизод
• F33 Рекуррентное депрессивное расстройство

4.Эпилепсия с частыми припадками — G40 — G41

Расшифровка кодов:

• G40 Эпилепсия
• G41 Эпилептический статус»

Расшифровка MAHC | Модельный код здоровья водной среды

Скачать

Расшифровка типового санитарного кода водных организмов Cdc-pdf [PDF — 1 страница] (только для печати)
Типовой санитарный кодекс водных организмов — проблема Cdc-pdf [PDF — 1 страница] (только для печати)
Типовой санитарный кодекс водных организмов — Процесс Cdc-pdf [PDF — 1 страница] (только для печати)
Типовой санитарный кодекс водных организмов — Продукт Cdc-pdf [PDF — 1 страница] (только для печати)

Описание

Расшифровка MAHC: Модельный код здоровья водной среды

MAHC — это бесплатный ресурс, основанный на науке и передовом опыте.Государственные учреждения и водный сектор могут использовать MAHC
, чтобы сделать плавание и другие водные развлечения более здоровыми и безопасными.

300 миллионов: поездок, которые люди в США совершают в бассейны и другие места для плавания каждый год.

Любителям плавания нравится:

• Улучшение физического и психического здоровья.
• Снижение риска хронических заболеваний, боли в суставах и мышцах, смерти.
• Повышение качества жизни и снижение инвалидности в пожилом возрасте.

The Problem: Но некоторые места, где мы плаваем, не чисты и не безопасны. 1 из 8 бассейнов сразу закрылся на плановую проверку на предмет серьезных проблем со здоровьем и безопасностью.

Проблемы могут привести к:

• Утопление: Основная причина непреднамеренной смерти детей в возрасте от 1 до 14 лет в результате травм.
• Вспышки: В течение 2000-2014 гг. Почти 500 вспышек были связаны с бассейнами, джакузи / спа и водными площадками.
• Посещение отделения неотложной помощи: Ежегодно от 3000 до 5000 человек посещают отделение неотложной помощи из-за травм, связанных с химическим веществом в бассейне, — почти половина посещений приходится на детей.

Решение: используйте MAHC

1. Для обновления существующих кодов для общественных бассейнов, гидромассажных ванн / спа и водных игровых площадок
2. Включить руководящие принципы, основанные на науке и передовом опыте
3. Как вы хотите: использовать, изменять, включать весь MAHC или его части

MAHC НЕ является федеральным законом.

Это типовое руководство CDC, которое штаты и местные сообщества могут добровольно принять, чтобы свести к минимуму случаи утопления, болезней и травм, связанных с общественными бассейнами, гидромассажными ваннами / спа и водными игровыми площадками.

Влияние на общественное здравоохранение:

MAHC может помочь:

• Предотвратите утопление, болезни и травмы.
• Повышение минимальных стандартов и сокращение нарушений при проверках.
• Держите бассейны открытыми, чтобы летом и круглый год было больше развлечений.

Сделайте плавание более здоровым и безопасным. Узнайте больше о Модельном санитарном кодексе водных организмов.

Начало страницы

Что такое медицинское кодирование?

Медицинское кодирование немного похоже на перевод.Кодировщики берут медицинские отчеты от врачей, которые могут включать в себя состояние пациента, диагноз врача, рецепт и любые процедуры, которые врач или поставщик медицинских услуг выполняли с пациентом, и превращают их в набор кодов, которые составляют важную часть медицинское заявление.

Почему мы кодируем

Давайте начнем с простого вопроса о медицинском кодировании: зачем мы кодируем медицинские отчеты? Разве недостаточно перечислить симптомы, диагнозы и процедуры, отправить их в страховую компанию и подождать, чтобы узнать, какие услуги будут возмещены?

Чтобы ответить на этот вопрос, мы должны взглянуть на огромное количество данных, которые влечет за собой каждый визит пациента.Если вы обратитесь к врачу с болью в горле и покажете ему такие симптомы, как жар, боль в горле и увеличенные лимфатические узлы, они будут записаны вместе с процедурами, которые выполняет врач, и лекарствами, которые он прописывает.

В таком простом случае, как этот, врач только официально сообщит о своем диагнозе, но это все равно означает, что часть этого отчета, которая будет закодирована, содержит диагноз, процедуру и рецепт.

Сделайте шаг назад, и внезапно появится много очень конкретной информации.И это только для относительно простого посещения врача. Что происходит, когда пациент приходит к врачу с тяжелой травмой или болезнью, например, с поражением глаз, связанным с диабетом 2 типа? По мере усложнения травм, состояний и болезней объем данных, которые необходимо передать страховым компаниям, значительно возрастает.

По данным Центров по контролю за заболеваниями (CDC), за последний год пациенты посетили более 1,4 миллиарда человек. Это статистика, которая включает посещения кабинетов врачей, поликлиник и пунктов неотложной помощи.Если бы за одно посещение приходилось всего пять фрагментов закодированной информации, что является почти нереалистично низкой оценкой, это было бы 6 миллиардов отдельных фрагментов информации, которые необходимо передавать каждый год. В системе, загруженной данными, медицинское кодирование позволяет эффективно передавать огромные объемы информации.

Coding также позволяет унифицировать документацию между медицинскими учреждениями. Кодекс стрептококковой ангины в Арканзасе такой же, как и на Гавайях. Наличие единообразных данных позволяет проводить эффективные исследования и анализ, которые правительство и учреждения здравоохранения используют для более эффективного отслеживания тенденций в области здравоохранения.Если CDC, например, хочет проанализировать распространенность вирусной пневмонии, они могут найти количество недавних диагнозов пневмонии, выполнив поиск по коду ICD-10-CM.

Наконец, кодирование позволяет администрациям оценить распространенность и эффективность лечения в их учреждении. Это особенно важно для крупных медицинских учреждений, таких как больницы. Подобно государственным учреждениям, отслеживающим, скажем, заболеваемость определенной болезнью, медицинские учреждения могут отслеживать эффективность своей практики, анализируя

Теперь, когда мы понимаем важность этой практики, давайте взглянем на три типа кода, с которыми вам придется познакомиться как медицинский программист.

Три типа кода, которые вам нужно знать

Есть три набора кодов, которые вы будете использовать ежедневно в качестве медицинского кодировщика.

ICD

Первый из них — это Международная классификация болезней или коды МКБ.

Это диагностические коды, которые создают единый словарь для описания причин травм, болезней и смерти. Этот кодовый набор был установлен Всемирной организацией здравоохранения (ВОЗ) в конце 1940-х годов.За более чем 60 лет с момента создания он несколько раз обновлялся. Число после «ICD» указывает, какая версия кода используется.

Например, в настоящее время в США используется код ICD-10-CM. Это означает, что это 10-я редакция кода МКБ. Этот «-CM» в конце означает «клиническая модификация». Таким образом, техническое название этого кода — Международная классификация болезней, десятая редакция, клиническая модификация. Клиническая модификация — это набор изменений, внесенных Национальным центром статистики здравоохранения (NCHS), который является подразделением Центра исследований в области Medicare и Medicaid (CMS).

Клиническая модификация значительно увеличивает количество кодов диагнозов. Этот увеличенный объем дает кодировщикам гораздо больше гибкости и специфичности, что очень важно для профессии. Чтобы дать вам представление о том, насколько важна клиническая модификация, код МКБ-10 включает 14 000 кодов. Его клиническая модификация, МКБ-10-СМ, содержит более 68 000 единиц.

ICD используются для обозначения диагноза врача и состояния пациента. В процессе выставления счетов эти коды используются для определения медицинской необходимости.Кодировщики должны убедиться, что процедура, за которую они выставляют счет, имеет смысл с учетом поставленного диагноза. Возвращаясь к нашему примеру с фарингитом, если кодировщик укажет диагноз фарингита как медицинское обоснование для рентгена, это утверждение, скорее всего, будет отклонено.

Обратимся теперь к двум типам кодов процедур.

CPT

Текущая терминология процедур, или коды CPT, используются для документирования большинства медицинских процедур, выполняемых в кабинете врача.Этот кодовый набор публикуется и поддерживается Американской медицинской ассоциацией (AMA). Эти коды защищены авторским правом AMA и обновляются ежегодно.

CPT — это пятизначные цифровые коды, которые делятся на три категории. Чаще всего используется первая категория, которая делится на шесть диапазонов. Эти диапазоны соответствуют шести основным медицинским областям: оценка и управление, анестезия, хирургия, радиология, патология и лаборатория, а также медицина.

Вторая категория кодов CPT соответствует измерению рабочих характеристик и, в некоторых случаях, результатам лабораторных или радиологических тестов.Эти пятизначные буквенно-цифровые коды обычно добавляются в конец кода CPT категории I через дефис.

Коды категории II не являются обязательными и не могут использоваться вместо кодов категории I. Эти коды полезны для других врачей и медицинских работников, и AMA ожидает, что коды Категории II снизят административную нагрузку на кабинеты врачей, предоставив им больше и более точную информацию, в частности, касающуюся работы медицинских работников и здравоохранения. удобства.

Третья категория кодов CPT соответствует новым медицинским технологиям.

Как программист, вы будете проводить большую часть своего времени с первыми двумя категориями, хотя первая, несомненно, будет более распространенной.

CPT также имеют дополнения, которые повышают специфичность и точность используемого кода. Поскольку многие медицинские процедуры требуют более высокого уровня детализации, чем предлагает базовый код CPT Категории I, AMA разработала набор модификаторов CPT.Это двузначные цифровые или буквенно-цифровые коды, которые добавляются в конец кода CPT категории I. Модификаторы CPT предоставляют важную дополнительную информацию к коду процедуры. Например, есть модификатор CPT, который описывает, на какой стороне тела выполняется процедура, а также есть код для прекращенной процедуры.

HCPCS

Система кодирования общих процедур здравоохранения (HCPCS), обычно произносимая как «hick picks», представляет собой набор кодов, основанных на кодах CPT.Коды HCPCS, разработанные CMS (той же организацией, которая разработала CPT) и поддерживаемые AMA, в первую очередь соответствуют услугам, процедурам и оборудованию, не охватываемым кодами CPT. Сюда входит медицинское оборудование длительного пользования, протезы, поездки на машинах скорой помощи, а также некоторые лекарства и медикаменты.

HCPCS также является официальным набором кодов для амбулаторного стационарного лечения, химиотерапевтических препаратов, программ Medicaid и Medicare, а также других услуг. Поскольку коды HCPCS используются в программах Medicaid и Medicare, это один из самых важных кодов, которые может использовать медицинский кодировщик.

Кодовый набор HCPCS разделен на два уровня. Первый из этих уровней идентичен кодам CPT, которые мы рассмотрели ранее.

Уровень II — это набор буквенно-цифровых кодов, который разделен на 17 разделов, каждый из которых основан на конкретной области, например, медицинские и лабораторные или реабилитационные услуги.

Как и коды CPT, каждый код HCPCS должен соответствовать диагностическому коду, который оправдывает медицинскую процедуру. Кодировщики обязаны убедиться, что любая амбулаторная процедура, подробно описанная в отчете врача, имеет смысл с перечисленным диагнозом, обычно описываемым с помощью кода ICD.

Теперь, когда вы получили лучшее представление о том, что представляет собой каждый из этих кодов и что они делают, давайте рассмотрим каждый набор кодов более подробно.

Видео: дополнительные сведения о медицинском кодировании

ученых завершили первую главу «Книги жизни», расшифровав первую хромосому человека

Ученые завершили первую главу «Книги жизни», расшифровав первую хромосому человека

декабрь 1999 г.

BETHESDA, Md. — Международная группа исследователей достигла научного рубежа, впервые разгадав генетический код всей хромосомы человека.

Об этом сообщается в выпуске Nature за эту неделю (2 декабря 1999 г.), исследователи из Центра Сэнгера недалеко от Кембриджа, Англия; Университет Оклахомы, Норман, Оклахома-сити; Вашингтонский университет, Сент-Луис, Миссури; и Университет Кейо в Японии сумели расшифровать последовательность из 33,5 миллионов «букв» или химических компонентов, составляющих ДНК хромосомы 22.

Эта последовательность включает самый длинный непрерывный участок ДНК, когда-либо расшифрованный и собранный. Его длина составляет более 23 миллионов букв.

Каждый человеческий ген состоит из ряда химических строительных блоков, представленных буквами A (аденин), T (тимин), G (гуанин) и C (цитозин). Число и порядок этих букв, также называемых основами, определяют, кто мы, как мы выглядим и к каким болезням мы можем быть предрасположены. Команда специалистов по хромосоме 22 вывела текст одной главы книги генетических инструкций человека.

Следующая грандиозная задача — определить, что все это значит. Усилия по секвенированию и картированию уже показали, что хромосома 22 вовлечена в работу иммунной системы, врожденные пороки сердца, шизофрению, умственную отсталость, врожденные дефекты и несколько видов рака, включая лейкемию. Но научная группа согласна с тем, что в этом расшифрованном тексте будет раскрыто еще много секретов.

Секвенирование хромосомы 22 позволяет ученым впервые увидеть всю ДНК хромосомы.

«Это первый раз, когда мы смогли увидеть организацию хромосомы на уровне пары оснований», — сказал д-р Ян Данэм, старший научный сотрудник Центра Сэнгера и руководитель исследовательской группы, которая расшифровала хромосому 22. «Это сразу же наводит на мысль о новых экспериментах и ​​направлениях исследований, которые можно продолжить».

«Увидеть всю последовательность хромосомы человека в первый раз — все равно что увидеть океанский лайнер, выходящий из тумана, когда все, что вы когда-либо видели раньше, были весельными лодками», — сказал д-р.Фрэнсис Коллинз, директор Национального института исследования генома человека (NHGRI) Национального института здоровья (NIH), который поддержал вклад США в секвенирование хромосомы 22.

Ученый из Университета Оклахомы доктор Брюс Роу, один из исследователей Кто расшифровал последовательность хромосомы 22, добавил: «Это невероятно. Впервые мы можем отойти в сторону и рассмотреть картину всех структур и других особенностей хромосомы человека, чтобы увидеть, как хромосома организована.Теперь мы можем начать понимать, где гены расположены на хромосомах, как они выражаются, как происходят делеции, вызывающие болезнетворные мутации, и как хромосомы дублируются и наследуются ».

Хромосома 22 является первой из 23 хромосом человека пары, которые необходимо расшифровать из-за его относительно небольшого размера и его связи с несколькими заболеваниями, а также из-за наработок нескольких ученых, начиная с начала 1990-х.

Поскольку гены, кодирующие белок, похоже, не встречаются на коротком плече хромосомы 22, Ученые сосредоточились на длинном плече хромосомы, которое богаче генами по сравнению с другими хромосомами человека.Девяносто семь процентов этой руки было секвенировано.

Последовательность содержит 11 пробелов или областей, которые невозможно расшифровать с помощью современных технологий. Были определены расположение и размер зазоров. 33,5 миллиона оснований секвенированной ДНК имеют исключительно высокое качество с частотой ошибок менее одного из 50 000 оснований.

Последовательность показывает следующее о ландшафте хромосомы 22:

• На хромосоме было обнаружено не менее 545 генов и 134 псевдогенов (гены, которые когда-то функционировали, но больше не работают), с 200-300 дополнительными. вероятный.Если это репрезентативно для других хромосом, этот подсчет предполагает, что общее количество генов на всех хромосомах человека не будет существенно больше или меньше, чем ранее оцененное количество в 80 000.
  
• Гены имеют размер от 1 000 до 583 000 оснований ДНК со средним размером 190 000 оснований. В общей сложности 39 процентов хромосомы копируется в РНК (экзоны и интроны), в то время как только 3 процента хромосомы кодирует белок.
  
• Компьютерный анализ показал, что в общей сложности 247 генов идентичны ранее идентифицированным человеческим генам или последовательностям белков.Компьютерный анализ последовательности хромосомы 22 обнаружил 150 дополнительных генов, последовательность ДНК которых сходна с известными генами. Были идентифицированы дополнительные 148 предсказанных генов, содержащих последовательности, гомологичные известным генетическим маркерам (EST).
  
• Несколько семейств генов, по-видимому, возникли в результате тандемной дупликации. Есть семейства генов, которые разбросаны среди других генов и распределены по большим хромосомным областям.
  
• Существует неожиданная дальнодействующая сложность хромосомы со сложным набором повторяющихся последовательностей около центромеры хромосомы.Наличие такого большого количества повторяющейся информации ДНК может помочь объяснить, как эта хромосома перестраивает или перетасовывает свою ДНК, что приводит к человеческим расстройствам, таким как синдром ДиДжорджи, который включает в себя форму умственной отсталости, и как структура хромосомы изменяется с течением времени.
  
• Неожиданное открытие показывает, что в нескольких областях рекомбинация повышена, а в других — подавлена, и они, вероятно, будут играть роль в здоровье и болезнях.

Сравнивая последовательность хромосомы 22 с известными последовательностями генов мыши, лабораторного животного, часто используемого для облегчения понимания генетических нарушений человека, исследовательская группа обнаружила 160 человеческих генов, которые имеют сопоставимые последовательности у мыши.Изучение хромосомных положений генов мыши, которые имеют аналоги на хромосоме 22 человека, показывает, что порядок генов вдоль хромосомы у двух видов генетически консервативен, хотя мышиные гомологи генов человека на хромосоме 22 распределены между восемью разными мышами. хромосомные области.

Секвенирование ДНК хромосомы 22 было проведено в рамках международного проекта «Геном человека» (HGP), в котором участвуют ученые из США, Англии, Японии, Франции, Германии и Китая.

При расшифровке 22-й хромосомы ученые использовали подход, разработанный и широко апробированный HGP. Этот подход включает секвенирование перекрывающихся клонированных сегментов ДНК из известных мест на хромосоме.

До сих пор ученые не знали, можно ли таким образом секвенировать целую хромосому человека. Например, они не знали, помешают ли непреодолимые проблемы собрать их данные секвенирования. Наличие небольшого числа неклонируемых разрывов не было неожиданным, но ученые, выполняющие этот проект, придерживались согласованного стандарта, согласно которому хромосома не должна считаться «по существу завершенной» до тех пор, пока последовательность областей, которые клонируемы и могут быть секвенированы с помощью текущего технологии определены с высокой точностью, а также определены размеры оставшихся зазоров.

«Эта 22-я хромосома была по существу секвенирована с использованием перекрывающихся клонов, что увеличивает нашу уверенность в том, что проект« Геном человека »сможет завершить« рабочий проект »последовательности ДНК человеческого генома весной 2000 года и завершить его к 2003 году», — сказал он. Доктор Ричард Уилсон, содиректор Центра секвенирования генома Медицинской школы Вашингтонского университета в Сент-Луисе и член исследовательской группы, которая расшифровала хромосому 22.

Результаты HGP, которые находятся в свободном доступе через общедоступные базы данных, такие как как GenBank [ncbi.nlm.nih.gov], дают ученым представление о том, как гены расположены вдоль полосы ДНК, и открывают путь к крупным достижениям в диагностике и лечении заболеваний.

Знание идентичности и порядка химических компонентов ДНК 23 пар хромосом, которые встречаются почти в каждой клетке человека, дает инструмент для определения основы здоровья и болезни. «Тот факт, что вся эта информация теперь свободно доступна для использования учеными, без ограничений, связанных с патентами и сборами, имеет большое значение, если мы хотим использовать знания о нашем генетическом строении на благо человечества», — сказал он. сказал докторМайкл Морган, исполнительный директор Геномного кампуса Wellcome Trust, в котором находится Центр Сэнгера.

Контактное лицо:
Кэти Ярбро
NHGRI

Для просмотра документов PDF на этой странице вам потребуется Adobe Acrobat Reader.

Редкие болезни в МКБ11: сделать редкие болезни видимыми в информационных системах здравоохранения с помощью соответствующего кодирования | Orphanet Journal of Rare Diseases

Десятое издание МКБ было выпущено в период с 1982 по 1989 год на ежегодных конференциях по пересмотру ограниченного числа экспертов, и оно было принято в 1990 году Всемирной ассамблеей здравоохранения.Предполагалось, что 10-летние (десятилетние) выпуски будут продолжаться в качестве метода пересмотра с промежуточными ежегодными обновлениями между ними. Когда в 2000 г. должен был состояться 11-й пересмотр, Исполнительный комитет ВОЗ предложил ввести мораторий на то, чтобы Секретариат разработал современную стратегию пересмотра в консультации с государствами-членами. Причиной этого предложения был недостаточный уровень принятия МКБ-10 государствами-членами: МКБ тогда использовалась только 96 государствами-членами из 191. Мораторий предлагал лучшую информативную поддержку реализации.В последующие годы ВОЗ решила вопросы внедрения в рамках Сети семейства международных классификаций ВОЗ (ВОЗ FIC), а затем сформулировала стратегию пересмотра в период с 2003 по 2007 год. Был разработан план процесса международного пересмотра для пересмотра содержания классификации в соответствии с достижениями в науках о здоровье и добавить желаемый функционал с использованием современных стандартов информатики здоровья. Цель заключалась в том, чтобы в открытом и задокументированном виде собрать отзывы всех заинтересованных сторон.Процесс пересмотра был инициирован письмом Генерального директора ВОЗ всем государствам-членам в апреле 2007 г.

Стратегия, принятая ВОЗ, была чрезвычайно амбициозной и трудной для реализации. Прогресс знаний с 1980-х годов (когда была разработана базовая структура МКБ-10) делает очевидной необходимость капитального ремонта. Одновременно необходимо управлять переходом от бумажных документов к электронным и использовать широкий спектр новых технических возможностей, открываемых развитием информационных технологий за последние два десятилетия.Отсюда и проект по превращению старой МКБ-10, которая в первую очередь задумывалась и использовалась в качестве справочного инструмента для статистики, в МКБ-11, предназначенную как универсальный справочный инструмент для любых условий, требующих использования интероперабельной классификации болезней с похожими характеристиками. (и позволяя производную разработку) энциклопедии и онтологии. К сожалению, пересмотр проводился довольно хаотично, с очень ограниченными средствами, учитывая его масштаб, амбиции и стратегическое значение, и столкнулся со значительными препятствиями и неудачами.Отсутствие финансирования повлияло на уровень профессионализма, которого можно было достичь. Разочаровывает контраст между изначально заявленными целями и предполагаемым конечным продуктом.

Организационные вопросы

Сотрудничество между TAGами было оставлено только на личную инициативу, поскольку TAG не получили четких инструкций о том, как они должны работать вместе. Тег Rare Disease TAG оказался особенно подходящим для решения этой проблемы, потому что объем его вмешательства включал почти все главы ICD и, естественно, заставил его взаимодействовать со многими другими TAG.На практике качество этих отношений было чрезвычайно различным: некоторые из них были эффективным сотрудничеством, некоторые были более сложными, но в конечном итоге плодотворными и привели к соглашению, но были также моменты полного расхождения. Выбранная модель развития распределенной терминологии [12] была больше экспериментом, чем реальным организационным выбором.

TAGs создавались постепенно в процессе пересмотра, без формального процесса, заранее определяющего их окончательное количество и точный объем деятельности: разделение ответственности между «первичными» и «вторичными» TAG (см. Выше) произошло довольно поздно во время написания альфа-проект.Поскольку TAG начали работать в разные периоды, их уровень понимания зависел от количества встреч RSG, которые они могли посетить, и их способности изучать инструменты сотрудничества. ТЕГи, которые начали работать позже, вполне естественно игнорировали большинство основных правил, согласованных в устной форме, но никогда не записывали подробно в руководящих документах. Примечательно, что полная полииерархия МКБ-11, которая позволяет всем другим ТАГам создавать новые иерархии болезней, относящихся к одной конкретной главе МКБ-10, не была понята многими ТАГами.Отсутствие ограничения по уровням детализации также не было понято. Несколько раз, очень редкие, но хорошо зарегистрированные заболевания, которые мы добавили в новую структуру, отклонялись TAG для соответствующей медицинской специальности как слишком редкие, чтобы представлять интерес, или лучше представлялись в виде условий включения объединенных категорий. Это было неприемлемо для нас и вызвало множество разногласий. Большинство ТАГов не соблюдали необходимость однозначных имен, когда-то считанных вне контекста.

Исходя из нашего опыта, отсутствие согласия по основным концепциям и принципам пересмотра и их присвоения со стороны TAG стало источником многих недоразумений между TAG.Мы полагаем, что больше внимания следовало уделять коллективному решению таких вопросов с самого начала пересмотра. Недостаточно времени было потрачено на ознакомление медицинских экспертов, задействованных в TAG, с требованиями эффективной информационной системы. Вместо этого первоначальный акцент был сделан на обучении членов TAG использованию инструментов для совместной работы. Хотя, конечно, нет никаких сомнений в том, что это было необходимо, мы утверждаем, что это было преждевременно до того, как очертания этого сотрудничества были эффективно урегулированы.Возникшие разногласия приходилось разрешать позже путем длительного, а иногда и сложного обмена письмами, личных встреч и телеконференций.

Многие формальные правила возникли в процессе пересмотра и были формализованы только через несколько лет после начала пересмотра. Следовательно, работу, проделанную над многими объектами, пришлось повторить позже, чтобы адаптировать данные к окончательно принятому формату. Ввиду ограниченных средств, выделенных на пересмотр, это создавало неоправданно большую рабочую нагрузку, поскольку задачи приходилось выполнять и переделывать снова и снова, отсюда много задержек, разочарования и иногда даже гнева по поводу всего процесса (приводящего, например, к отставке).Здесь невозможно не пожалеть о потере времени, которое можно было бы сэкономить за счет нормализации с самого начала.

Приведем несколько примеров такой поздней формулировки правил. Информационные записки, формализующие различные аспекты, были подготовлены только с конца 2011 по 2013 год, то есть через два года после начала процесса пересмотра и через четыре года после предварительных обсуждений в 2007 году [13]. Правила наименования болезней не были ясны для многих TAG, несмотря на существование руководства по стилю ВОЗ.В частности, изначально были созданы многие имена, которые имели смысл только в иерархической структуре, в которую была включена сущность, но которые не имели бы смысла в алфавитном списке, таком как индекс ICD-11. Шаблон того, как следует писать краткие определения, был формализован специальной группой ВОЗ только в 2014 г. [14].

В целом, похоже, что во многих ТЕГах было понятное сосредоточение на медицинских вопросах, но за счет тех, которые связаны с организацией знаний в информационной системе.Это показывает, что опыт организаторов ревизии в области информатики, к сожалению, не был передан достаточно эффективно экспертам, участвующим в TAG. Большая часть их времени, вероятно, ушла на присвоение инструментов, предоставленных в их распоряжение, хотя они действительно это сделали, поскольку мы знаем, что большая часть предложений была наконец реализована официальными лицами ВОЗ. Личные встречи между каждым TAG и официальными лицами ВОЗ оказались абсолютно необходимыми, прежде чем бета-версия могла быть разумно запущена.

В качестве альтернативы, мы думаем, что полное признание такого разделения задач между медицинскими экспертами и информатиками было бы более эффективным. Время и деньги можно было сэкономить, собрав информацию из медицинской литературы и воспользовавшись клиническими модификациями МКБ-10, используемыми в различных странах. Некоторые их элементы могли быть использованы при пересмотре, но общий анализ так и не был представлен. Здесь TAG упустили возможность получить представление о существующих потребностях практикующих кодировщиков на местах, оценить их согласованность в разных странах и сравнить эту обратную связь с направлениями пересмотра, необходимыми для развития знаний.На основе этих данных специалисты в области информации могли бы подготовить предварительный проект в соответствии с общими принципами МКБ-11, как и планировалось RSG. Затем этот проект должен был быть представлен экспертам для обсуждения, и были проведены конференции для достижения консенсуса. Наконец, специалисты по информационным технологиям внедрили бы определенную структуру в iCAT и представили результат экспертам для проверки.

TAG по редким заболеваниям довольно успешно использовала эту организацию.Мы также в несколько раз испытали гораздо большую добавленную стоимость прямого личного обсуждения по сравнению с электронной почтой или даже телефонными звонками, и хотим особенно поблагодарить всех экспертов, которые посвятили нам часть своего времени, чтобы напрямую обсудить МКБ-11. структура вместе.

Концептуальные вопросы

Предполагалось, что процесс пересмотра приведет к созданию последовательной классификации, основанной на текущем состоянии науки и адаптированной к потребностям пользователей. К сожалению, обсуждение структуры происходило только на уровне TAG по информатике и моделированию здравоохранения (HIM), на концептуальном уровне, и никогда между всеми членами Руководящей группы по пересмотру (RSG).Ни на одном из заседаний RSG не было специального заседания для обсуждения основных принципов, регулирующих пересмотр структуры. В результате нынешняя структура МКБ-11 по крайней мере так же противоречива, как и в МКБ-10.

С самого начала пересмотра, особенно во время предварительных обсуждений с 2007 по 2009 год, HIM TAG и RSG, похоже, были очень впечатлены моделью социальных сетей в крупномасштабном информационном проекте, предоставленном Википедией, бесплатной онлайн-энциклопедией, которая кто угодно может редактировать.Это определенно успешная модель совместной работы: на сегодняшний день в английской версии опубликовано более 4 600 000 статей, хотя и на всех возможных уровнях развития и качества. С другой стороны, создание общей общедоступной энциклопедии и последовательного справочного инструмента для классификации — это совершенно разные усилия: в то время как первый может процветать в децентрализованной среде, поскольку темы очень разнообразны и согласованность не обязательно является проблемой (с возможностью перекрестные ссылки по внутренним ссылкам), последнее требует гораздо более тщательно формализованной структуры.Подход «снизу вверх», поддерживаемый RSG, особенно на ранних этапах пересмотра, мог оказаться эффективным для создания всемирной энциклопедии болезней; но для создания последовательной классификации, достижения консенсуса по ссылкам и обеспечения преемственности с предыдущими версиями ICD с самого начала было неизбежно дополнительное управление сверху вниз. Тем не менее, RSG предоставила TAGs очень свободную (слишком свободную) возможность самоорганизации и определения основных линий структур, которые они строили.Иллюстрацией результата этого отсутствия направления являются заметно разные подходы, принятые различными TAG. Хотя такие разные подходы могут быть похвальными, когда соответствующие медицинские специальности рассматриваются изолированно, глобальный результат, похоже, не имеет четко определенных классификационных принципов. Это затрудняет понимание и может стать препятствием в будущем для присвоения кодировщиками. Например, глава о болезнях пищеварительной системы в основном разделена по анатомическому признаку (Таблица 3), тогда как глава по неврологии следует более этиологическому подходу [15] (Таблица 4).В главе, посвященной гематологии, не удалось достичь консенсуса, поэтому сосуществуют два разных взгляда: один по классически описанным клиническим группам (анемии, полицитемии, геморрагические заболевания, тромботические заболевания и т. Д.), Соответствующий проекту TAG по редким заболеваниям, второй на основании этиологии (дефицит железа, дефицит витамина B12, другие пищевые и метаболические анемии, гемолитические анемии и т. д.) в соответствии с требованиями Рабочей группы по гематологии TAG по внутренним болезням. Большинство сущностей являются общими, но структуры совершенно разные, что позже будет иметь последствия для анализа в зависимости от того, какая из них будет выбрана для агрегирования данных.Согласно процедурам пересмотра МКБ, на базовом уровне МКБ-11 должна была быть разработана общая классификация; конкретные представления должны быть представлены на уровне линеаризации, адаптированные для различных вариантов использования. В качестве последнего примера в главе, посвященной болезням системы кровообращения, используется несколько подходов одновременно, что затрудняет рассмотрение в виде древовидной структуры (таблица 5).

Многовариантные объекты часто рассматриваются неоднородно из-за отсутствия правил управления множественной классификацией объектов по сравнению с другими.классификация болезни и ее конкретных проявлений. Ранее было заявлено, что система «крестик и звездочка», используемая в МКБ-10 для обозначения первичного и вторичного вовлечения, будет прекращена. К сожалению, долгое время не было ясно, как его заменить. Таким образом, группы TAG, столкнувшиеся с необходимостью отражения вторичных проявлений или конкретных проявлений определенных заболеваний, испробовали множество творческих решений, что привело к большой разнородности по главам. Типичным случаем было инфекционное или мультисистемное заболевание, созданное несколько раз для каждого из его различных проявлений, при этом они не были связаны где-либо под общим заголовком, представляющим болезнь в целом, или заголовок мог быть создан без включения или ранжирования подтипов. для различных проявлений.Долгое время эта проблема стояла остро, но теперь решается (в основном официальными лицами ВОЗ) путем установления правильных родителей. Тем не менее, проблемы все еще не решены; например, в пищеварительной системе, язвы, вызванные болезнью Крона или саркоидозом, не имеют формальной связи с болезнью Крона или саркоидозом.

Технические проблемы

Инструмент iCAT имел некоторые ограничения, хотя и второстепенные по сравнению с организационными и концептуальными проблемами, описанными выше. Необходимо четко указать, что эти ограничения связаны с отсутствием надлежащего финансирования для поддержки этого амбициозного процесса после того, как основное приложение, изначально разработанное, было отклонено.Впоследствии инструмент iCAT был разработан на добровольной основе очень небольшой, но, к счастью, очень опытной, активной и преданной своему делу командой.

Несмотря на то, что iCAT эффективен и удобен для документирования заболеваний и управления иерархиями, он не был разработан для учета различий во взглядах редакторов в процессе с несколькими авторами. Был сделан выбор, позволяющий любому редактору редактировать любую сущность; в результате, до того, как права редактирования были постепенно ограничены на этапе бета-проекта, заключительный этап отражал решение последнего редактора, и его всегда можно было снова оспорить, что приводило к большой нестабильности.Единственный способ указать на различия — оставить редакционные заметки, поскольку инструмент позволяет аннотировать все данные в виде произвольного текста. Хотя эта функция явно полезна для документирования причин изменений и ссылки на источник, на практике она оказалась непригодной для проведения длительных дискуссий между редакторами, которые, следовательно, велись в основном по частной электронной почте и, следовательно, недоступны на платформе для консультаций. и цитирование.

Проблема была решена в бета-браузере МКБ-11, по которому широкой общественности предлагается проконсультироваться и прокомментировать предстоящий МКБ-11: здесь представлена ​​более централизованная система, в которой комментарии фильтруются ВОЗ и отправлено в соответствующие теги.

Неспособность iCAT управлять редакционными правами и обязанностями, вкупе с отсутствием четких правил, привели к возникновению стрессовой ситуации, когда тысячи часов работы могут быть стерты другой группой, изменяющей содержимое iCAT без какого-либо диалога, без возможности для восстановления предыдущей версии. Это было контрпродуктивно и неуважительно. Это была пустая трата ресурсов, заканчивающаяся хаотичным конечным продуктом.

В начале пересмотра внутренняя поисковая машина платформы была довольно неэффективной и работала только на точных совпадениях между символьными строками в заголовках сущностей.Это не позволяло пользователю эффективно проверять, не был ли объект, предназначенный для создания с помощью тега, еще ранее добавлен другим. Поскольку, естественно, существует много совпадений между областями медицины, относящимися к различным тегам, это привело к появлению огромного количества повторяющихся записей, которые впоследствии пришлось обнаруживать (частично с помощью автоматических сценариев) и решать одну за другой. рукой. Что касается обнаруженных дубликатов, то в сентябре 2014 г. эта обрезка была близка к завершению.Однако следует подчеркнуть, что это была неприятная и трудоемкая задача, которую можно было бы хотя бы частично избежать, отложив работу над iCAT до того, как поисковая система будет исправлена, чтобы обеспечить достаточно эффективную защиту от создания такого большого количества дубликатов. . Также остается возможность дублирования на концептуальном, а не на лексическом уровне, то есть сосуществование сущностей, которые имеют очень похожую область видимости, но названы так по-разному, что невозможно обнаружить проблему чисто формальными средствами.На данный момент нет другого пути, кроме как полагаться на опыт TAG, чтобы справиться с этой проблемой.

Проект «Геном человека» | Геном: открытие кода жизни

Проект «Геном человека» (HGP) стартовал в 1990 году как сотрудничество международных исследователей, общей целью которых было составить карту и понять все гены человека. Весь генетический материал человека, вместе взятый, включая все гены и другие элементы генома, составляет его «геном».

Ученые HGP использовали несколько подходов для декодирования генома человека: они изучили порядок, или последовательность , из более чем 3 миллиардов оснований в ДНК человека.Они составили карты, показывающие расположение генов на наших хромосомах — непростая задача, учитывая 20 500 генов в геноме человека. И они создали карты сцепления , которые можно использовать для отслеживания наследственных признаков, таких как генетические заболевания, на протяжении многих поколений.

Расшифровка первой последовательности генома человека заняла от шести до восьми лет активного секвенирования и стоила около 1 миллиарда долларов.Сегодня геном человека можно секвенировать за один-два дня и стоит от 4000 до 5000 долларов. Дальнейшее сокращение — до менее чем 1000 долларов — ожидается в ближайшие несколько лет.

Конечным достижением HGP было предоставление миру подробной информации о структуре, организации и функции полного набора человеческих генов — «набора инструкций» для человека. Проект также способствовал гигантскому скачку в наших знаниях о нарушениях, вызванных дефектами одного гена. До начала HGP мы знали генетические основы около 60 редких генетических заболеваний; когда он закончился, число подскочило до 2200.Сегодня, благодаря исследованиям, инициированным HGP, мы знаем геномную основу почти 5000 редких заболеваний.

Инструменты и технологии, созданные для достижения этой цели, также использовались для декодирования геномов исследуемых организмов, таких как мыши, круглые черви и дрозофилы. Секвенированы геномы собак, кошек, коров, свиней, даже опоссума и утконоса. В 2003 году исследователи секвенировали геномы трех позвоночных животных; Сегодня известно 112 последовательностей генома позвоночных.

Отличительной чертой масштабных международных исследований HGP была его приверженность открытости, быстрому обмену информацией между исследовательскими группами по мере ее обнаружения и предоставлению ученым всего мира беспрепятственного доступа к данным о человеческой последовательности.Информация, полученная с помощью HGP, продолжает широко распространяться, с постоянным стремлением анализировать ее этические, правовые и социальные последствия, а также соответствующие варианты политики.

Ресурсы

. Объяснение часто используемых генетических терминов, таких как ДНК, хромосома, геном, протеом, и их связи друг с другом и с проектом «Геном человека»; от Министерства энергетики США

Ссылка непосредственно на контент:

» расшифрован | MIT Technology Review

Меня учили, что «генетические заболевания», такие как кистозный фиброз, вызываются мутацией одного гена, и известно лишь небольшое количество этих мутаций.На сегодняшний день известны точные причины 2800 этих редких моногенных заболеваний.

Меня ничего не учили более сложной генетике обычных болезней. Сегодня мы с головокружительной скоростью узнаем о взаимодействии генов и окружающей среды при диабете, сердечных заболеваниях и других распространенных состояниях. Только за последние три года было обнаружено более 1000 генетических факторов риска (увеличение, возможно, в 50 раз), способствующих более чем 100 распространенным заболеваниям.

Такие успехи произошли бы намного позже, если бы вообще были, без проекта «Геном человека» (см. «Геном человека, десятилетие спустя») .Но совокупность знаний — не единственное его наследие. Это также изменило способ проведения биологических исследований.

Меня научили рассматривать научные данные как частную собственность каждого исследователя. Группы исследователей генетики человека были вовлечены в «гонку» за обнаружение каждого гена болезни, и были победители и проигравшие. Это часто приводило к фрагментации усилий и давало результаты, которые другие не могли воспроизвести. Данные собирались вручную и хранились в бумажных блокнотах.

Проект «Геном человека» придерживался революционной точки зрения, согласно которой собранные данные должны быть доступны для всех.Сегодня эта точка зрения преобладает в геномике и многих других областях биологии и медицины. Ученые всего мира обмениваются данными в Интернете.

Сегодня, в немалой степени благодаря примеру проекта генома, исследователи, работающие над одним и тем же заболеванием, часто публикуют публикации вместе. Такое сочетание клинических и генетических данных увеличивает статистическую надежность заявленных результатов и обеспечивает высокую воспроизводимость результатов.

Конечно, одного знания генома человека недостаточно для лечения болезни.Всегда будет так, что креативность, упорный труд и удача будут необходимы, чтобы воплотить биологические данные в медицинский прогресс. Но без информации, понимания и культурных изменений, вызванных геномным проектом, польза для пациентов была бы намного больше.

Дэвид Альтшулер — член-основатель, заместитель директора и главный научный сотрудник Института Броуда в Гарварде и Массачусетском технологическом институте, а также профессор генетики и медицины Гарвардской медицинской школы.

jackwasey / icd: быстрые сопутствующие заболевания ICD-10 и ICD-9, декодирование и проверка в R. NB используйте main вместо master для ветви по умолчанию.

Введение

Рассчитывайте сопутствующие заболевания, оценку медицинского риска и работайте очень быстро и именно с кодами МКБ-9 и МКБ-10. Этот пакет обеспечивает рабочий процесс от исходных таблиц кодов МКБ в больничных базах данных до сопутствующих заболеваний. Сопоставление коморбидности по МКБ-9 и МКБ-10 от Куана (Дейо и Эликсхаузер). версии), Elixhauser и AHRQ включены.Общие двусмысленности и код форматы обрабатываются. Вычисление коморбидности включает иерархическую Коды состояний и внедрение клинических классификаций AHRQ. Оценки риска включают оценки Чарлсона и ван Вальравена. Клиника США Модификация, Всемирная организация здравоохранения, бельгийский и французский коды МКБ-10 поддерживаются, большинство из которых загружаются по запросу.

icd используется многими исследователями по всему миру, которые работают в общественных местах. здоровье, эпидемиология, клинические исследования, питание, журналистика, здоровье администрирование, страхование и многое другое.Я благодарен за контакт с людей в этих областях за их отзывы и вклад в код, а также Я рад сообщить, что icd использовался в таких работах, как Пулитцеровский финалист работа по материнской смерть от ProPublica.

Характеристики

• найти сопутствующие заболевания у пациентов по кодам МКБ-9 или МКБ-10, например Рак, болезнь сердца
  • несколько стандартных сопоставлений кодов МКБ с сопутствующими заболеваниями. в комплекте (Quan, Deyo, Elixhauser, AHRQ, PCCC)
  • очень быстро присвоение кодов МКБ сопутствующим заболеваниям (с использованием новый алгоритм умножения матриц и C ++ внутри — см. Виньетка «эффективность» для подробностей)
• использует ваш существующий широкий или длинный формат данных, icd может угадать, какой столбцы — коды МКБ-9 или МКБ-10.
• объяснять и резюмировать группы кодов МКБ на естественном языке, используя Редакции МКБ из ВОЗ, США, Франции и Бельгии. Много разных доступны годовые выпуски этих данных, и они могут быть загружается автоматически при использовании или массово с download_all_icd_data () .
• Расчеты по шкале Чарлсона и Ван Вальравена
• Иерархические коды состояний (HCC) из CMS
• Программное обеспечение для клинической классификации (CCS) сопутствующих заболеваний из AHRQ
• Педиатрические комплексные хронические заболевания, сопутствующие заболевания
• AHRQ ICD-10, классификация процедурных кодов
• правильное преобразование между различными представлениями кодов ICD, с десятичными знаками и без них, начальные и конечные символы (это нетривиально для МКБ-9-СМ).Переход от МКБ-9 к МКБ-10 еще не реализовано
Комплексный набор тестов
• для повышения уверенности в точности обработка кодов ICD

Примеры

См. Также виньетки и примеры, встроенные в справку для каждого функция для получения дополнительной информации. Вот вкус:

 # install.packages ("icd")
библиотека (icd)

# Типичные данные диагностического кода с отношением "многие ко многим"
пациент_данные
#> visit_id icd9
#> 1 1000 40201
#> 2 1000 2258
#> 3 1000 7208
#> 4 1000 25001
#> 5 1001 34400
#> 6 1001 4011
#> 7 1002 4011
#> 8 1000 

# получить сопутствующие заболевания с помощью приложения Куана для групп коморбидности Дейо по Чарлсону
comorbid_charlson (данные пациента)
#> MI CHF PVD Инсульт Деменция Легочная Ревматическая ЯБЕНЬ Легкая
#> 1000 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
#> 1001 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
#> 1002 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
#> DM Паралич DMcx Рак почек Печень Тяжелые отношения с ВИЧ
#> 1000 ИСТИНА ЛОЖЬ ЛОЖЬ ЛОЖЬ ЛОЖЬ ЛОЖЬ ЛОЖЬ
#> 1001 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE
#> 1002 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE

# или сразу переходите к счетам Чарлсона:
чарлсон (данные_ пациента)
#> 1000 1001 1002
#> 2 2 0

# построить сводку выборочных данных из реестра рака урана с использованием сопутствующих заболеваний AHRQ
plot_comorbid (uranium_pathology) 

Пример сопутствующих заболеваний: составьте сводные данные «Таблицы 1»

Общее требование к медицинским исследованиям с участием пациентов: определение новых или существующих сопутствующих заболеваний.Об этом часто сообщают в Таблица 1 исследовательских работ, чтобы продемонстрировать сходство или различия групп пациентов. Этот пакет ориентирован на быстрое и точная генерация этой информации о коморбидности из необработанных списков Коды МКБ-9 и МКБ-10.

Здесь мы используем данные Национального исследования выписки из больниц США за 2010 г. из пакета nhds. Ради Например, давайте сравним неотложную помощь с другими госпиталями. Настоящий стол имел бы более терпеливые черты; это в первую очередь демонстрирует, как получить Коды ICD в вашу Таблицу 1.

сопутствующих заболеваний NHDS 2010 для демонстрации создания Table One. Представлено как подсчитывает (процентная распространенность в группе).

 nhds <- nhds :: nhds2010
# получить сопутствующие заболевания, используя версию Quan-Deyo категорий Чарлсона
cmb <- icd :: comorbid_quan_deyo (nhds, abbrev_names = FALSE)
nhds <- cbind (nhds, cmb, stringsAsFactors = FALSE)
Y <- nhds $ adm_type == "аварийный"
tab_dat <- vapply (
  unname (unlist (icd_names_charlson)),
  function (x) {
    c (sprintf ("% i (% .2f %%)",
              сумма (nhds [Y, x]),
              100 * среднее (nhds [Y, x])),
      sprintf ("% i (%.2f %%) ",
              сумма (nhds [! Y, x]),
              100 * означает (nhds [! Y, x])))
  },
  персонаж (2)
)
knitr :: kable (t (tab_dat), col.names = c («Аварийный», «Не аварийный»)) 

Как получить помощь

Подробную информацию и примеры почти каждой функции см. В файлах справки. в этом пакете.Есть несколько виньеток, показывающих основные особенности (См. Список с виньеткой (package = "icd") ):

• Введение виньетка ("Introduction", package = "icd")
• Charlson набрал баллов ("charlson-scores", package = "icd")
• Примеры использования кодов ICD-10 виньетка ("ICD-10", package = "icd")
• CMS Hierarchical Condition Codes (HCC) vignette ("CMS-HCC", package = "icd")
• Педиатрические комплексные хронические состояния (PCCC) виньетка ("PCCC", package = "icd")
• Работа с диапазонами кодов ICD виньетка ("range", package = "icd")
• Сравнение карт коморбидности виньетка ("compare-maps", package = "icd")
• Бумага с подробным описанием эффективного матричного метода сопутствующих заболеваний виньетка ("efficiency", package = "icd")

Многие пользователи писали мне напрямую с просьбой о помощи, и я сделаю все, что в моих силах, но часто лучше изучить или добавить в список проблемы, чтобы мы могли помогать друг другу.Опытные пользователи могут посмотреть источник код, особенно обширный тест набор, который выполняет все ключевые функции.

? Коморбидный
? comorbid_hcc
? объяснять_код
? is_valid 

Коды МКБ-9

МКБ-9 все еще широко используются во всем мире, особенно в США, где широко использовался МКБ-9-СМ (клиническая модификация). до конца 2015 года. МКБ-10 использовалась во всем мире для отчетности причина смерти более десяти лет, и МКБ-11 должен быть выпущен в 2019 году.ICD-10-CM теперь является основной схемой кодирования для больниц США. диагнозы госпитализации и выписки, используемые в нормативных целях и биллинг. С помощью МКБ-9 регистрируется огромное количество электронных данных о пациентах. какие-то коды: этот пакет позволяет использовать их в R вместе с МКБ-10.

Коды МКБ-9 не являются числами, поэтому при сопоставлении требуется большая осторожность. индивидуальные коды и диапазоны кодов. Легко ошибаться, поэтому необходимость этого пакета. Коды МКБ-9 могут быть представлены в коротком 5 символьный формат, или десятичный формат , с десятичным разделителем код на две группы.Также есть коды, начинающиеся с V и E которые имеют разные правила проверки. Нули после десятичного разряда имеет смысл, поэтому в большинстве случаев нельзя использовать числовые коды МКБ-9. В кроме того, большинство клинических баз данных содержат неверные коды и даже десятичные и недесятичные коды формата в разных местах. Этот пакет в первую очередь имеет дело с кодами МКБ-9-CM (клиническая модификация), но следует быть применимыми или легко расширяемыми до исходной системы ВОЗ МКБ-9.

Коды МКБ-10

МКБ-10 имеет несколько более простой формат с последовательным использованием букв, затем два буквенно-цифровых символа.Однако, особенно для МКБ-10-СМ, существует множество квалификаторов, например с указанием повторения, латеральность, что значительно увеличивает количество возможных кодов. Этот пакет распознает действительность кодов только по синтаксису или коды появляются в каноническом списке. Пока нет возможности переход между МКБ-9 и МКБ-10, но могут возникать сопутствующие заболевания из старых кодов МКБ-9 и новых кодов МКБ-10 параллельно, а затем можно сравнивать сопутствующие заболевания.